如何选择水族箱底砂，这是水族迷们争论的一个问题。有人说它应该细到让水底生活的鱼类感觉到在上面很舒适。其他的人又说它得够粗，以确定水流或循环可以通过底层，才能防止水族箱的砂床腐败或变黑。
表面上看来，这两种观点都有一定的道理。养鲶科鱼类是可爱、有趣的鱼类，它们在水族箱中执行一项非常有用的功能，它们以底层里外的任何东西为食，若这些东西不除去的话，就可能腐烂而不利于水族箱。粗状、锐边的砂石并不存在于它们的天然繁殖地，在太粗糙的砂石层上，它们可能损害自己味觉敏感的触须，这终究会导致它们无法进食而死亡。
由此看来，水族箱底层的砂石要越细越好。太粗的底砂(即砂直径大于4厘米)，是不可能被接受的：由于碎屑易于沈淀在粗石之间，随后便会被细菌分解开来。时间一久，碎屑小到一个程度时，底层的水循环实际上就被堵塞住了。
它似乎形成一道细密的水泥层，若要将您的手指在底层戳个洞，好植入新的植物，甚至都变得很困难。若底层是属于细质的砂，碎屑会沉淀在砂床“上面”；然后在下次换水时，就可以容易被吸起。
同时，底层也不应太过细密，因为这可能导致其所需的水循环完全崩溃。基于此原因，只要砂石或碎石直径小于1厘米，都不应该考虑在内。
对于小型水族箱底层的要求条件，我们的建议非常直截了当：
不具加温系统的小型水族箱中：以三分之一矽砂与Duplarit基肥的混合物为最底层，加上三分之二洗过的矽砂，直径1～2厘米，整个底层高度2～3公分。在没有底部加温的水族箱里，我们需要将底层高度限制在较低的标准，因为它缺乏提高温度的功能，因而会影响到水的循环。藉由较低的高度或厚度，我们能够促进有限而必需的水流流动或交替。
装有底部加温系统的水族箱中：底层高度可达3～5公分，因为经由加温线，水的温度上升，通过底层产生有效的水流，在这里，我们也选择1～2厘米的砂石粒，在这两种情形下，您应该确定上层的砂石，在放入水族箱之前，已彻底地冲洗干净。
在水族箱的早期阶段，每次换水的时候，仔细的以清缸换水器冲洗底层是比较明智的，尤其是靠近前面玻璃的部分，这里的底层有较快变黑的倾向。以后，等水草的根一旦扩散开来，我们便可知道砂床腐烂的危机已经消失。
至此，我们就会明白，不论是草泥丸、有色砂石或粗石粒，都和水族箱的底层搭不上关系。