所有水草的病原体对水草皆有感染性，但水草病害的发生并非是病原体与水草间的单纯关系。环境中的非生物及生物因子对病原体的致病力及水草的抗病力均有直接的作用。当水中的环境不利于水草的生长，如水温过高或过低、光照不足、营养元素过多或缺乏、PH及硬度不适、施用化学药剂、螺类或者人为伤害等情况时使水草抗病力降低，这样便增加了病原体致病的机会。病原体利用自身的能力直接由表皮细胞侵入水草体内，或经由水草上的自然开口或伤口侵入。每一种病原体都有一定的侵入途径，有的只能通过一种途径侵入，有的能通过多种途径侵入。病原体侵入水草的植物体后便与水草形成一种寄生关系。当水草的抗病力降低或条件适合于病原体生长时，病原体便大量繁殖，数目呈几何级数增加。这些病原体依*水草体内的营养维持其生长、繁殖，水草细胞内的代谢作用被病原体所分泌的毒素、激素等干扰，水草细胞内的物质不断被破坏、消耗，或是植物体内营养物质输导被阻塞，导致水草不规则运用能量，并产生各种病害症状，如叶片卷曲、植株腐烂等。大部分病原体仅能局部感染，但有少部分病原体既能局部感染又能全株感染。局部感染的病原体一般感染部位仅限于根、茎、叶等的某一部分，故即使到了病害末期，也仅是植株的局部腐烂而已，而全株感染的病原，可以在水草的任何部位感染，到了病害末期，全株腐烂而死。因此对水草疾病和敌害的预防治应遵循“以防为主、治疗为辅、防中兼施、防重于治”的原则。
1.正确选择水族箱位置
应注意切勿将水族箱置于直射阳光下，因为这对大多数水族生物而言太强烈了。水草被提供了太多的代谢能量，使之在相对少量的水体中消耗了过多营养，很快就导致了营养失衡而生长被抑制，这时藻类就占据优势了。
2.在引入新的水草前要检查
不要购买长着藻类的水族箱中的水草，在水草买回家后栽插进你的水族箱前还要彻底检查一遍，检查是否有藻类潜藏。
3.盆装水草的处理
买来的盆装水草多半是专业草场里栽培的。通常水草茎叶会伸出水面，而根部浸于富含氮磷的特殊营养液中。当水草被从其着极的种植池里移出时，并未被仔细地冲洗。所以在买回种人自己的水族箱前，应小心地将水草从盆里取出，并用温水彻底洗净。
4.适当的水质处理和有规律的换水
给水草提供所有必需的养分。（包括微量元素），是让水草得以健康生长并远离藻类侵害的先决条件。例如，使用水草肥料就可以提供正确的营养剂量，这些水草肥料，综合了所有必需的微量元素的日常供给。通过施加这些经过仔细配伍的养分及元素组合，就可以避免部分疾病的发生。但是在添加中一定要注意量的保证，微量元素一旦过量，就会对水草造成毒害而使得藻类乘虚而入。
5.通过添加二氧化碳来调控PH值
调控水体PH值在6.8－7.2之间，不只是为了提供水草足够的碳需求，而且可以让整个水体化学环境处于有利于促进生长发育的状态。为达到这个目的，配备合适的二氧化碳发生或添加装置是值得的。
6.合适的光照
水族箱上方的光照应与水族箱高度和体积相配合。首先，光源必须足够强以使得生长在箱底最小的水草植株都得到充分的光照。光照也要与水族养分供给相匹配，太多太强的光照会使得某些养分特别是微量元素的缺失，从而导致藻类开始生长。而太少太弱的光照则会使水草生长停滞和氧气的缺乏。
选择合适的照明：对于50cm高的水族箱用80－125w的水银灯；对于高于50cm的水族箱用 70－150w的卤素灯。
7.每日的照料
应每天检查藻类是否出现，尤其在水族箱建立的初期更有必要在底层或水草根部一但发现蓝藻层出现，或延伸至叶缘时，要立刻将之移除。