金鱼的非寄生性疾病防治方法有以下几种：一、烫尾病
烫尾病是金鱼特有的一种病症。其发病季节多集中于炎热暑夏的露天鱼池，尢以长尾鳍的老鱼多见。其发病通常由于高温和闷热引起。在光照强、溶氧足的浅绿水中及投饵不足、人为惊动等影响下，氧分子随鱼体尾鳍活动而渗入各鳍条中，形成许多似米粒的小气泡，由于气泡的浮力，烫尾的金鱼失去平衡，鱼头朝下，若不及时换水降温，则各鳍条烂成许多缺损处，影响观赏。防治方法：①暑夏时节，将鱼池遮荫1/3~1/2或在水中种植几棵大叶水浮莲与水葫芦，可起到较好的预防效果。②投饵要足、要早，让金鱼饱食后减少活动，这是减少烫尾的主要措施。③患烫尾病的金鱼，重者当天下午必须换水，轻者则对水一层，经过两天的饲养可恢复正常。④暑夏时节，下午清洁工作必须在日落后进行，可抑制此病发生（室内饲养金鱼除外）。
二、中暑
盛夏的午后，水温通常可达38~40℃，未遮荫的鱼苗或成鱼，常因高温和强光的刺激而突然中暑，病重者呼吸困难，体色变淡，失去感觉，倒浮于水面，难以救治。
防治方法：①盛夏上午10时前盖帘遮荫，防止池水因烈日曝晒升温过快。对轻度中暑者，应及时换水降温，经抢救后金鱼可免于一死。②盛夏期间，必须提高饲养水位40~50厘米，防止池水升温过快，预防中暑发生。
三、中毒
金鱼中毒通常发生于药物浸洗鱼体，或者将药物直接泼洒于池中。如药物的剂量与水浴时间掌握不好，容易引起金鱼中毒死亡。此外，自来水中有氯气，若曝气时间短，氯气并未散尽便饲养金鱼，则会引起慢性中毒，快则1小时左右，慢则1~2天，因此，换水后的半小时内应注意观察，如发现金鱼团集缸池四周，而不在中间游动时，正是轻度中毒征兆，应立即投放大苏打。防治方法：提倡合理用药，注意观察，操作细心。
四、窒息
当水中溶氧减小到一定程度时，金鱼会感到呼吸困难，不时到水表层将口伸出水面吞吐空气，这样重复多次，若时间过长则会引起金鱼死亡。此种情况多发生于金鱼放养密度过大的金鱼场或家庭鱼缸。
防治方法：①必须认真做好夜间的水质处理工作，视水质、鱼情及时换水或注水。②有条件可辅助进行充氧或装置水质循环过滤器。③视当时天气、水质等情况酌情投饵。
五、体腹翻转
金鱼发生翻转病，以在深秋及冬初多见，其中以体短腹圆的狮头、虎头较多见。其主要原因一是气温变低，特别是网鳞、透明鳞的金鱼怕寒，最易导致此病发生。二是运输时过刻或饲养密度过大，金鱼处于低氧呼吸状态，待换入清水后，有的不易恢复正常，伏卧不起。三是喂食过饱或食物较硬，也容易导致此病发生，类似情况全国各地都有发生。
防治方法：①把体形短圆的金鱼，过冬前置于暖房中饲养，要想避免此病的发生，需选择体形适中的金鱼与其杂交培育，进行品种改良工作。②饵料的营养成分要全面，投饵量要根据金鱼的摄食情况而增减。③平常的饲养工作，应减少对金鱼肠胃及鳃的刺激。
六、感冒
金鱼的感冒一年四季都有发生。但多数发生在寒冷的冬天及初春，由于换水时新旧水温差过大所致。在寒冷的天气捕捉金鱼及在连阴天气换水，均引起金鱼身体不适，精神呆滞，皮肤粘液分泌失调，常离群独卧于池底。病情严重者行动失常，经常漂浮于水面，又易受其他病原体的感染。
防治方法：①日常换水要注意保持新旧水温的一致，掌握冬天换入的新水略高于原水水温1~2℃，夏天则略低1~2℃，在阴雨天气、发病季节力求做到新旧水温的一致。②若水温处理不妥，可采用食盐水和小苏打水浸洗鱼体1~2次的方法治疗。③春冬季节应尽量饲养在较深水色的缸池中，尽量减少捕捉或惊动。④利用微生物防病治病，达到“以水养鱼，以水治病”的目的。苔条藻具有吸收水中的氯、抑制细菌的功能，能起到较好的净水作用。红藻具有粘附、抑制细菌的作用，在春秋发病旺季，如进行大量繁殖，可获得较好的治病效果。