了解工厂化养殖温室各种环境的基本特点和作用后，我们在养殖过程中应根据龟鳖的生物学基本特性为其创造最佳的生长环境进行科学调控，但在调控过程中须掌握以下几条原则：一是要以提高效益降低成本为前提；二是要简单易行；三是不得影响商品质量。
1、工厂化控温温室空间环境的要求与调控
由于室内空间环境不但严重影响鳖的正常生活，也会影响水生态的变化。如当鳖在水质恶化被动逃到水上呼吸时，如果此时室内有害气体浓度较高，就极易中毒死亡，否则反之。同样当室内阳光充足时会使水中光合增氧的生物发生，对水中溶氧状况的改善就有极大的帮助，否则也反之。所以我们按下列要点控制空间环境。
1.1室内保温。龟鳖正常生长的室温要求：国产龟鳖吃食时达到32℃，食后自然降到30℃。境外鳖(东南亚)吃食时达到34℃，食后自然降到32℃。调控方法可用锅炉加温或通风降温。
1.2保持干燥。室内湿度，最好控制在70％以内，如超过可用增温或通气来调节。湿度太大会影响水环境中有害气体的溢出和加快病害的传播。
1.3定期排气。室内应保持无异味，当臭味或有害气体浓度较高时，应打开气窗或排气扇排出。排气的时间最好是在投喂后1小时或在室内进行其它操作时进行，一般要求冬季不低于1小时，春季不低于2小时，秋季不少于3小时，夏季不低于5小时。
1.4定时采光。通常采光温室的光照除了阴雨天气，一般不缺光照。但全封闭的却完全靠人工补足，光照要求一天不低于8小时，一天中除在温室内操作时的光照外，最好晚上22～24时之间的时段再开灯2小时。
1.5减少惊扰。严格控制室内的操作时间，减少人为惊扰。一般要求一昼夜操作时间不超过4～6小时。平时除了必要的巡查，尽量不去室内活动，同样室外也应杜绝强度很大的刺激性干扰。
2、工厂化温室水生环境的要求与调控
2.1充气。温室鳖池水中充气，是通过螺蛳鼓风机把室外空气用动力通过管道压到水中，使水在强大气流推动下运动，从而达到水中气体与空间气体进行大量交换的目的。是目前工厂化高密度养殖调控水环境的重要措施之一。为了达到既有效又省电的目的，充气时间的安排十分重要。目前许多地方从放下龟、鳖苗开始就每天24小时地充气用电，实属浪费。正确的安排是，苗刚放养后的两个月因相对密度很低，吃食排污也少，所以对水环境的负面影响极小，这段时间就不用充气。当龟鳖长到50g以上后可开始充气，由于充气应与温室放气相结合，因为当水中有害气体溢出水体到空间后如不及时放出室外，当有害气体达到一定浓度时，龟鳖同样也会中毒死亡。所以充气一般应安排在白天的凌晨5点到晚上8点，因这段时间饲养员和技术人员有几次要到室内操作观察，当人进去后鳖一般都在水中，而且这时室外的气温也相对较高，可以在操作的同时安排放气，所以这段时间水中充气，不会增加室内有害气体的浓度。晚上8点后，一般不会再进温室操作(特殊情况除外)龟鳖也大多在栖息台上，很少在水中，当然也不会在这段时间安排温室放气，所以这段时间就不用充气，可省下电能节约开支。
2.2排污。由于养殖水体的好坏取决于池中污物存量的多少，所以去污是使水体保持良性的首要任务。去污可采取以下两种方法：一是吸污装置直接把污泥排出池外，用这种方法不但简单有效，还可节约许多成本：二是采用排底层水法，即每天排出底层黑水1～2cm，然后补上新水。这种方法相对较麻烦，但也比大换水要好些。
2.3捞出过多的“红虫”。在养鳖池中发现有大量的“红虫”时，说明池水严重缺氧开始变质，往腐败的趋向发展。但因“红虫”同时也能吞食大量的细菌，所以保持一定的数量还可以起到控制病原菌预防鳖病的作用，通过试验研究，把红虫的数量控制在每升水15000个以内为好，调控的方法是用80目大小网眼的筛绢缝制成捞斗及时捞出过多的红虫。
2.4适当换水。通常可在分养或转池需降低水位或清底时换水。
2.5配合应用生物制品。在上述措施的同时结合应用生物制品，来稳定和改善水环境，如EM、芽胞杆菌等。
2.6调节pH。因龟鳖适合在微碱性的水环境中生长，所以水体pH应保持在7～8之间，调节的方法是，水体排污后用生石灰20g/立方米化好后均匀泼洒。切忌在长时间没排污的水体中泼生石灰。